MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 plasmid pCE3

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004320	A	6	6	189	194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004320	TGT	2	6	279	284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004320	AAGC	2	8	326	333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004320	GA	3	6	364	369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004320	TGGA	2	8	417	424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004320	GTCT	2	8	435	442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004320	GAG	2	6	443	448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004320	GCT	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004320	TCC	2	6	487	492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_004320	GCT	2	6	537	542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004320	CCTGCT	2	12	562	573	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004320	CGC	2	6	719	724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_004320	TAGA	2	8	725	732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004320	TG	4	8	752	759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004320	CA	4	8	770	777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004320	ACG	2	6	853	858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004320	TC	3	6	861	866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004320	CAC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_004320	GC	3	6	1191	1196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004320	AGA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004320	GAT	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004320	CAC	2	6	1347	1352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_004320	CGG	2	6	1363	1368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004320	CATAA	2	10	1381	1390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_004320	GCT	2	6	1454	1459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004320	CCA	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577987
27	NC_004320	CAAG	2	8	1551	1558	50 %	0 %	25 %	25 %	23577987
28	NC_004320	A	7	7	1678	1684	100 %	0 %	0 %	0 %	23577987
29	NC_004320	GA	3	6	1777	1782	50 %	0 %	50 %	0 %	23577987
30	NC_004320	TGA	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577988
31	NC_004320	TCC	2	6	1918	1923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577988
32	NC_004320	CAG	2	6	1941	1946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577988
33	NC_004320	CTC	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577988
34	NC_004320	CCG	2	6	2012	2017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577988
35	NC_004320	GTT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577988
36	NC_004320	AAG	2	6	2140	2145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577988
37	NC_004320	CAC	3	9	2154	2162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577988
38	NC_004320	TCAGA	2	10	2167	2176	40 %	20 %	20 %	20 %	23577988
39	NC_004320	TGG	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577988
40	NC_004320	CCG	2	6	2216	2221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577988
41	NC_004320	TACC	2	8	2253	2260	25 %	25 %	0 %	50 %	23577988
42	NC_004320	TGG	2	6	2324	2329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577988
43	NC_004320	TTC	2	6	2570	2575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577988
44	NC_004320	ACA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577988
45	NC_004320	TCC	2	6	2739	2744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577989
46	NC_004320	CCA	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577989
47	NC_004320	CG	3	6	2780	2785	0 %	0 %	50 %	50 %	23577989
48	NC_004320	CGA	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577989
49	NC_004320	CGT	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577989
50	NC_004320	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577989
51	NC_004320	GATA	2	8	2931	2938	50 %	25 %	25 %	0 %	23577989
52	NC_004320	CAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577989
53	NC_004320	TACC	2	8	2978	2985	25 %	25 %	0 %	50 %	23577989
54	NC_004320	TCG	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577989
55	NC_004320	AAC	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577989
56	NC_004320	TGG	2	6	3081	3086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577989
57	NC_004320	A	6	6	3088	3093	100 %	0 %	0 %	0 %	23577989
58	NC_004320	ACC	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577989
59	NC_004320	AGCT	2	8	3101	3108	25 %	25 %	25 %	25 %	23577989
60	NC_004320	GC	4	8	3175	3182	0 %	0 %	50 %	50 %	23577989
61	NC_004320	TGC	2	6	3212	3217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577989
62	NC_004320	ACC	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577989
63	NC_004320	A	6	6	3314	3319	100 %	0 %	0 %	0 %	23577989
64	NC_004320	CAGA	2	8	3323	3330	50 %	0 %	25 %	25 %	23577989
65	NC_004320	CAG	2	6	3342	3347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577989
66	NC_004320	TC	4	8	3413	3420	0 %	50 %	0 %	50 %	23577989
67	NC_004320	TGC	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577989
68	NC_004320	ACAT	2	8	3472	3479	50 %	25 %	0 %	25 %	23577989
69	NC_004320	AG	3	6	3527	3532	50 %	0 %	50 %	0 %	23577989
70	NC_004320	T	7	7	3644	3650	0 %	100 %	0 %	0 %	23577989
71	NC_004320	TAC	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577989
72	NC_004320	ACCT	2	8	3701	3708	25 %	25 %	0 %	50 %	23577990
73	NC_004320	TTC	3	9	3731	3739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577990
74	NC_004320	GCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577990
75	NC_004320	CAA	2	6	3796	3801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577990
76	NC_004320	TCA	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577990
77	NC_004320	GC	3	6	3824	3829	0 %	0 %	50 %	50 %	23577990
78	NC_004320	C	6	6	3867	3872	0 %	0 %	0 %	100 %	23577990
79	NC_004320	CAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577990
80	NC_004320	TCG	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577990
81	NC_004320	GGT	2	6	3960	3965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577990
82	NC_004320	T	6	6	4028	4033	0 %	100 %	0 %	0 %	23577990
83	NC_004320	TCA	3	9	4041	4049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577990
84	NC_004320	TC	3	6	4204	4209	0 %	50 %	0 %	50 %	23577990
85	NC_004320	ATG	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577990
86	NC_004320	ATA	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004320	ATT	2	6	4428	4433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004320	TAA	2	6	4434	4439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004320	CAA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577991
90	NC_004320	GAGG	2	8	4749	4756	25 %	0 %	75 %	0 %	23577991
91	NC_004320	TGA	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577991
92	NC_004320	TAAG	2	8	4876	4883	50 %	25 %	25 %	0 %	23577991
93	NC_004320	CGA	2	6	4911	4916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577991
94	NC_004320	GTG	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577991
95	NC_004320	TTG	2	6	4957	4962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577991
96	NC_004320	GTT	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577991
97	NC_004320	TGC	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577991
98	NC_004320	GCT	2	6	5058	5063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577991
99	NC_004320	ACA	2	6	5097	5102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577991
100	NC_004320	ATC	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577991
101	NC_004320	CGT	2	6	5259	5264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577992
102	NC_004320	TGG	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577992
103	NC_004320	GTG	3	9	5409	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577992
104	NC_004320	T	7	7	5469	5475	0 %	100 %	0 %	0 %	23577992
105	NC_004320	ATC	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577992
106	NC_004320	TGG	2	6	5525	5530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577992
107	NC_004320	TCC	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577992
108	NC_004320	TTG	2	6	5659	5664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577992
109	NC_004320	ATT	2	6	5702	5707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23577992
110	NC_004320	TG	3	6	5709	5714	0 %	50 %	50 %	0 %	23577992
111	NC_004320	GAG	3	9	5774	5782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577992
112	NC_004320	GA	3	6	5847	5852	50 %	0 %	50 %	0 %	23577992
113	NC_004320	TTAA	2	8	5879	5886	50 %	50 %	0 %	0 %	23577992
114	NC_004320	TTC	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577992
115	NC_004320	GGC	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23577992
116	NC_004320	CTC	2	6	5998	6003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577992
117	NC_004320	CTT	2	6	6012	6017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577992
118	NC_004320	GAA	2	6	6045	6050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577992
119	NC_004320	AGA	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577992
120	NC_004320	ATG	2	6	6191	6196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577992
121	NC_004320	CAC	2	6	6238	6243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577992
122	NC_004320	AAAT	2	8	6246	6253	75 %	25 %	0 %	0 %	23577992
123	NC_004320	AGC	3	9	6314	6322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577992
124	NC_004320	TGA	2	6	6334	6339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577992
125	NC_004320	ACG	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577992
126	NC_004320	ATA	2	6	6360	6365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23577992
127	NC_004320	ATA	2	6	6387	6392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23577992
128	NC_004320	GTG	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577992
129	NC_004320	TGCG	2	8	6489	6496	0 %	25 %	50 %	25 %	23577992
130	NC_004320	CCTGT	2	10	6554	6563	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_004320	GTG	2	6	6627	6632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577993
132	NC_004320	GCT	2	6	6667	6672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577993
133	NC_004320	GGC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23577993
134	NC_004320	CCG	2	6	6811	6816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577993
135	NC_004320	AGA	2	6	6840	6845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577993
136	NC_004320	CGA	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577993
137	NC_004320	GAC	2	6	6869	6874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577993
138	NC_004320	ATC	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577993
139	NC_004320	CTC	2	6	6910	6915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577993
140	NC_004320	CCA	2	6	6928	6933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577993
141	NC_004320	A	6	6	6953	6958	100 %	0 %	0 %	0 %	23577993
142	NC_004320	AGC	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577993
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144	NC_004320	GCT	2	6	7125	7130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577994
145	NC_004320	CCG	2	6	7146	7151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577994
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148	NC_004320	GGT	2	6	7188	7193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577994
149	NC_004320	TCA	2	6	7256	7261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577994
150	NC_004320	CGCC	2	8	7284	7291	0 %	0 %	25 %	75 %	23577994
151	NC_004320	TGG	2	6	7311	7316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577994
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154	NC_004320	CGC	2	6	7437	7442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577994
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157	NC_004320	ATA	2	6	7603	7608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23577995
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166	NC_004320	CTC	2	6	7973	7978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577995
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173	NC_004320	TC	3	6	8511	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_004320	TTC	2	6	8547	8552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_004320	CAT	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_004320	AGAA	2	8	8623	8630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_004320	A	6	6	8634	8639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_004320	AGA	2	6	8641	8646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_004320	TCT	2	6	8665	8670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_004320	TCT	2	6	8697	8702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_004320	CGTGAT	2	12	8895	8906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	23577997
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191	NC_004320	AT	3	6	9128	9133	50 %	50 %	0 %	0 %	23577997
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246	NC_004320	GAT	2	6	11648	11653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_004320	TCT	2	6	11703	11708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_004320	AAT	2	6	11795	11800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_004320	CGT	2	6	11856	11861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_004320	GAC	2	6	11889	11894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_004320	AACA	2	8	11915	11922	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
252	NC_004320	A	8	8	11940	11947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_004320	AGG	2	6	12018	12023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_004320	CGG	2	6	12027	12032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23577999
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259	NC_004320	TGT	2	6	12226	12231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577999
260	NC_004320	CGG	2	6	12296	12301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23577999
261	NC_004320	GT	3	6	12354	12359	0 %	50 %	50 %	0 %	23577999
262	NC_004320	GAA	2	6	12391	12396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577999
263	NC_004320	TGA	2	6	12403	12408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577999
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265	NC_004320	GAT	2	6	12499	12504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577999
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268	NC_004320	GGCA	2	8	12873	12880	25 %	0 %	50 %	25 %	23577999
269	NC_004320	AGACAC	2	12	12898	12909	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	23577999
270	NC_004320	GGA	2	6	12916	12921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577999
271	NC_004320	GCCCA	2	10	13030	13039	20 %	0 %	20 %	60 %	23577999
272	NC_004320	AGC	2	6	13065	13070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577999
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274	NC_004320	TGG	2	6	13095	13100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577999
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399	NC_004320	GATT	2	8	18207	18214	25 %	50 %	25 %	0 %	23578001
400	NC_004320	CTC	2	6	18215	18220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23578001
401	NC_004320	CTA	2	6	18221	18226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578001
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403	NC_004320	ATC	2	6	18349	18354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578001
404	NC_004320	GAT	2	6	18370	18375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23578001
405	NC_004320	TAG	2	6	18401	18406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23578001
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408	NC_004320	TAT	2	6	18492	18497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23578001
409	NC_004320	AGCT	2	8	18503	18510	25 %	25 %	25 %	25 %	23578001
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452	NC_004320	CGT	2	6	20056	20061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_004320	CTGG	2	8	20225	20232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
456	NC_004320	TA	3	6	20271	20276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_004320	GAG	2	6	22481	22486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_004320	CG	3	6	22664	22669	0 %	0 %	50 %	50 %	23578004

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